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技術(shù)文獻(xiàn)

PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)中經(jīng)常出現(xiàn)的問題及解決辦法 2024資料已更新
閱讀次數(shù):15280 發(fā)布時(shí)間:2024/1/4 9:29:47
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  PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)中經(jīng)常出現(xiàn)的問題及解決辦法

  在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),京城會(huì)遇到一些問題,需要改變各種影響PCR擴(kuò)增的參數(shù)及條件,以改善反應(yīng)產(chǎn)物的常量和特異性。

  1、沒有得到所希望的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物。

 、俅_定是加入酶,檢查酶是否具有活性。

 、贒NA分子解鏈?zhǔn)欠癯浞帧?/p>

 、奂尤氲娜斯ず铣梢锸欠駹幦。

  ④在未加入Taq DNA聚合酶之,將反映系統(tǒng)放置在95℃保溫5-10分鐘,以使蛋白酶及核酸酶失去活性。

  2、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物在凝膠電泳中呈片狀。

  ①減少Taq DNA聚合酶的濃度。

 、谠黾油嘶鸬臏囟

  ③降低Mg++的濃度。

 、軠p少擴(kuò)增循環(huán)周期次數(shù)。

 、轀p少退火及延伸的時(shí)間。

 、迯哪z中回收與所希望的段大小相同的DNA,再次進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

  3、凝膠電泳中出現(xiàn)引物二聚體區(qū)帶

 、贆z查引物的3`-端是否互補(bǔ)。

 、谠O(shè)計(jì)較長的引物。

 、墼黾影心繕(biāo)DNA的量。

 、芙档鸵锏臐舛。

  ⑤減少擴(kuò)增循環(huán)周期次。

 、拊黾油嘶鸬臏囟

  4、PCR擴(kuò)增產(chǎn)物特異性不夠

 、僭黾油嘶鸬臏囟。

  ②減少退火及延伸時(shí)間。

  ③降低引物和Taq DNA聚合酶的濃度。

  ④改變Mg++的濃度

  預(yù)防PCR擴(kuò)增中污染的措施:

  1、擴(kuò)增所用的試驗(yàn)要少量分裝保存,為一次實(shí)驗(yàn)的使用。

  2、實(shí)驗(yàn)中實(shí)驗(yàn)人員要穿工作服、戴手套,尤其是RT-PCR擴(kuò)增的過程中必須戴手套。

  3、實(shí)驗(yàn)中加取標(biāo)本和反應(yīng)試劑要迅速、準(zhǔn)確、盡量減少標(biāo)本取樣的次數(shù),并就近操作,避免遠(yuǎn)距離一樣,陽性對照加入。

  4、PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)中所使用的要用,不可竄用。

  5、實(shí)驗(yàn)中使用的加樣頭,標(biāo)本處理和擴(kuò)增用的離心管要高壓滅菌消毒。

  6、加權(quán)樣本和擴(kuò)增產(chǎn)物時(shí),不要反復(fù)抽吸和空吸,避免產(chǎn)生氣溶膠,污染實(shí)驗(yàn)室。

  7、要嚴(yán)格執(zhí)行先加入反映實(shí)際,后加入標(biāo)本DNA。

  8、擴(kuò)增過程中的流程要有次序,避免已經(jīng)入下步驟的擴(kuò)增標(biāo)本,返回到一步驟,造成污染。

  PCR擴(kuò)增過程中污染的主要來源

  核算擴(kuò)增是一項(xiàng)很有效的技術(shù),但同時(shí)優(yōu)勢很靈敏的方法以至于很容易出現(xiàn)假陽性的反應(yīng),這種假陽性反應(yīng)的干擾主要產(chǎn)生于3個(gè)方面

  1、應(yīng)用DNA質(zhì)粒作為核算擴(kuò)增反應(yīng)的陽性對照。

  2、DNA由林勇標(biāo)本,培養(yǎng)物或由被污染的試劑延續(xù)下來。

  3、擴(kuò)增DNA的污染(即PCR產(chǎn)物)。

  PCR擴(kuò)增產(chǎn)物污染的主要排出方法:

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